蛋白质全谱分析也可称为质谱shot-gun分析（鸟枪法），指的是蛋白质质谱检测，研究对象是完整的组织、血液、体液或其提取物，其目的在于鉴定出尽可能多的肽段和蛋白质。蛋白全谱分析的优势就是可以全面鉴定整个细胞、组织或复杂混合样品的大量蛋白质。基于质谱技术的蛋白全谱分析，可为高通量的蛋白质谱定量和修饰分析提供重要参考信息。
蛋白质全谱分析图
技术原理
将溶液内蛋白质分子或SDS-PAGE条带的复杂混合物酶解成肽段混合物，通过液相色谱分离，如2D-LC（阳离子柱SCX和C18反相柱串联）或1D-LC的C18反相柱，进行蛋白质谱测试，最后用相应的数据库进行检索匹配，可同时鉴定成百上千种蛋白质。
技术流程
技术平台
应用领域
全蛋白质表达谱分析 蛋白质质谱检测 血浆蛋白质组表达分析
植物蛋白质组表达分析 微生物蛋白质组表达分析 亚细胞器蛋白质组表达分析
互作蛋白质种类鉴定
样品要求
蛋白质提取物：浓度>4μg/μl，蛋白质总量 >5mg;
细胞样品：细胞量>108 ;
组织样品：湿重>300mg;
体液样品：血液体积>1ml
